台塑麥寮廠因非法棄置超過5萬公噸石灰在台南市轄區內，遭環保局重罰7472萬餘元，並限期進行清理，台塑對此裁罰不服，提起行政訴訟，經過長達10年的纏訟，最高行政法院於6月判決台南市政府勝訴，市長黃偉哲強調，環境正義不容妥協，市府將全程監督，確保環境得到徹底復原，9月台塑已開始正式進行清除作業。
根據環保局局長許仁澤的說法，台塑麥寮廠在生產過程中產出不具市場價值的副產品石灰，以每公噸僅2元的價格出售，並額外支付清運公司每公噸650元的運費，將這些石灰運送至台南市內的土石方堆置場，然而，這看似正當的交易實際上是以假產品之名，行廢棄物棄置之實，涉嫌違反《廢棄物清理法》，2013年1月24日，環保局查獲此不法行為，隨即裁罰台塑公司新台幣1億4196萬元，並限期要求改善。
未料，台塑未在期限內完成改善，環保局因此依規定按日（次）進行追加處罰，最終累積罰款達7472萬4000元，台塑不服裁處，提起行政訴訟，經過多次上訴與法律攻防，最高行政法院於6月21日做出最終判決，確認台塑未合法清除事業廢棄物，需負有清理與改善的責任。
為加速處理這一環境污染問題，環保局隨後邀請台塑公司與案址地主進行協商，決定以擱置爭議的方式，由台塑公司提出完整的廢棄物清理計畫，該計畫經環保局審核通過後，已於9月初正式展開在麻豆區的清理工作，至於左鎮區的清理將待相關行政程序完備後進行。
環保局強調，裁罰只是手段，最終目的是促使污染行為者承擔責任，恢復受損的環境，市府期許企業能夠遵守環保法令，履行社會責任，而不是為了利益鋌而走險，隨意棄置廢棄物，破壞環境。
