涉及刑事的醫療糾紛，有時會需醫師協助「醫事鑑定」釐清案情，但2024年5月15日實施《刑事訴訟法》新制，要求鑑定人須具結、具名、出庭，使醫師參與鑑定意願大幅降低，刑事醫療鑑定幾乎停擺，近一年有700多件案件更因此停滯。對此，民進黨立委林淑芬今（6）日質詢時關切該議題，她說數月前行政院長卓榮泰答應過要進行院際協調，可至今仍停擺。卓榮泰臉色鐵青，語氣不滿地質問一旁的衛福部長邱泰源說，「部長（指邱泰源）為什麼八個月來我們的進展如此之慢？」
過去遇到醫療糾紛的刑事訴訟案件時，法院會向衛福部詢問「醫事鑑定」意見表達，由衛福部找合適的專科醫師提供初步鑑定意見，由衛福部醫事審議委員會（醫審會）做成鑑定書送交法院。但司法院去年5月15日推動「刑事訴訟法」新制，要求提供醫事鑑定的醫師須要具結、具名及到庭以言詞說明，不少醫師參與鑑定的意願降低，醫事鑑定變得窒礙難行，近一年有超過700件醫糾案件因此停擺。
林淑芬表示，在去年5月1日修法到現在，已經剛好整整滿一年，可想而知台灣一年會有多少醫療糾紛需要刑事訴訟，而刑事訴訟的前提要建立在醫療糾紛的醫事鑑定、責任鑑定上面，那新的修法規定說，醫事鑑定的醫師須要具結、具名及到庭以言詞說明，這對現行的醫事上的鑑定制度造成很大的衝擊。
林淑芬指出，我們的醫審會他們拒絕再鑑定，從去年的大概8月15日以後，到現在也將近九個月了，全台灣拒絕受理任何的醫療糾紛的醫事鑑定，到現在累積了有700多件的醫療糾紛的案子。
林淑芬說，這一次的修法，導致法務部檢查單位都沒有辦法進行刑事訴訟的程序，衛福部也堅持立場，司法院也堅持立場，八個月以前她拜託卓榮泰能不能進行院際協調，「那時候你答應我 可是到現在仍然停擺怎麼辦？」
卓榮泰聽到這臉色鐵青地看向一旁的邱泰源，並且當場質問「部長（指邱泰源）為什麼八個月來我們的進展如此之慢？我也沒有再收到新的一個報告」、「非常抱歉，部長能不能再說明一下」。
邱泰源強調，衛福部非常重視這個問題，也一直在溝通，也與高等檢察署已經研議短期先解決方案，有鑑定的需要可以洽請相關的協會或公會，提供醫療專業意見，5月1日也開始試辦醫療專業意見試辦計畫。
林淑芬則認為或許可以解決行政程序的困擾，但仍無法解決司法程序的困擾。卓榮泰表示，該方式5月1日開始試辦，讓它有一段時間，看看是否有辦法解決，如果沒辦法解決或要更好的方法，他跟委員承諾，會再請政委林明昕研究，用院際方式商討這個問題。
