台鹽綠能公司當年在台南推動漁電共生，爭議不少，不僅間接造成一些承租魚塭的漁民失業，也有跟地主鬧不愉快的案例。一名在地方上很有名望的大地主，曾被台鹽綠能邀請一起推漁電共生，但在簽約同意前，土地就被插下密密麻麻的光電基樁，更發現開發商竟變成另一家能源公司，才驚覺被擺了一道，氣得向民代陳情。
據悉，這名地主因為因持有50多公頃的魚塭土地，當初台鹽綠能在台南圈地推動漁電共生時也找上他，還拿出「董事長會來與他簽約」等語說服。由於該地主年事已高，家族也不須仰賴養殖漁業為生，基於響應政府2025非核家園政策，他口頭答應讓台鹽綠能租地，卻沒料到，一直遲遲等不到對方所說的「董事長」來簽約。
令該地主更氣憤的是，還沒有簽約，工人就已在他的土地打設基樁，後來還發現，接洽他的開發商變成另一家能源公司，當下直覺「被唬了」，趕緊請立委民代協助處理，事情才落幕。但他也很生氣，台鹽綠能掛著台鹽的金字招牌推動光電，換取地主信任，結果圈地後就把權利轉讓給第三家公司，地主卻全程被蒙在鼓裡，太離譜了。
除了有地主因漁電共生土地差點被騙走，還有許多養殖漁民因此沒了工作；一名熟悉台南沿海產業的人士指出，1公頃魚塭過去一年租金大約3、4萬元，光電業者來圈地，喊出一年40萬元的租金，原本租地養魚的漁民根本付不起這種租金，許多人被逼退，無法再繼續養殖。
該名人士還說，政府當初沒有妥善規畫，放任光電業者自行圈地、推動光電，以前常聽到種電會地主、業者、政府「三贏」，但這幾年看下來，只有業者、政府「保證贏」，不僅承租漁民，即使是地主也可能受害。
